Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms