Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JAG1P78504 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JAG1P78504 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms