Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP46P62068 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP46P62068 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP46P62068 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP46P62068 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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USP46P62068 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP46P62068 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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USP46P62068 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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USP46P62068 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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USP46P62068 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP46P62068 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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USP46P62068 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP46P62068 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP46P62068 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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