Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms