Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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OTX2P32243 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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