Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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HOXA13P31271 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXA13P31271 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXA13P31271 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXA13P31271 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXA13P31271 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXA13P31271 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HOXA13P31271 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HOXA13P31271 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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