Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms