Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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