Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DMDP11532 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DMDP11532 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DMDP11532 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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