Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PF4P02776 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PF4P02776 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PF4P02776 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PF4P02776 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PF4P02776 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PF4P02776 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PF4P02776 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PF4P02776 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PF4P02776 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PF4P02776 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PF4P02776 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PF4P02776 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PF4P02776 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PF4P02776 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PF4P02776 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PF4P02776 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PF4P02776 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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