Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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