Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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