Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTNAP2Q9UHC6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTNAP2Q9UHC6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTNAP2Q9UHC6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTNAP2Q9UHC6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTNAP2Q9UHC6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTNAP2Q9UHC6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTNAP2Q9UHC6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms