Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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C9orf16Q9BUW7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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