Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms