Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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