Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 PTCH2-201ENST00000372192 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 FAM196A-202ENST00000522781 4403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 DPP4-201ENST00000360534 3904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 NR4A2-201ENST00000339562 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 TMEM178B-202ENST00000565468 10558 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 TMEM178B-203ENST00000610315 10552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 SALL4-201ENST00000217086 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 POTEA-201ENST00000519951 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 TMEM169-205ENST00000454545 3460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 OGFOD1P1-201ENST00000447552 1592 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 PRIMA1-203ENST00000393143 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 AL121772.1-201ENST00000618303 2335 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 PPP4R1L-202ENST00000334187 2746 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ABCG1-206ENST00000398457 3119 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 GRHL3-204ENST00000361548 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 GBA-203ENST00000427500 2063 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 DPY19L3-201ENST00000342179 6015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ASB9-203ENST00000380488 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 DNASE1-201ENST00000246949 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 EIF4A1P13-201ENST00000415667 230 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 LINC02354-202ENST00000548564 573 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 LDLR-208ENST00000558518 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 NLRP12-204ENST00000391773 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 ZNF30-201ENST00000303586 2579 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 FOXO3-203ENST00000540898 2553 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 STRAP-201ENST00000025399 1442 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 TMEM108-202ENST00000393130 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 IGSF11-204ENST00000441144 1952 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 DPPA2-201ENST00000478945 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 GPRASP2-201ENST00000332262 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SVIPQ8NHG7 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms