Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LINC01545Q5VT33 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LINC01545Q5VT33 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LINC01545Q5VT33 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LINC01545Q5VT33 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LINC01545Q5VT33 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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