Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms