Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms