Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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