Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms