Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 C8orf17-202ENST00000625034 2775 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.7 ms