Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FAM3AP98173 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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