Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms