Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

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Length 1,807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSC2P49815 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSC2P49815 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSC2P49815 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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