Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 LGALS14-201ENST00000360675 773 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TRAF3IP3-201ENST00000367023 1065 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL139220.1-201ENST00000436802 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CCDC58-205ENST00000479899 545 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms