Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms