Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTGFP29279 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CTGFP29279 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms