Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms