Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM225BP0DP42 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms