Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC099509.2-201ENST00000513926 406 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PAX8-AS1-217ENST00000617509 627 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CCNYL2-201ENST00000472090 1440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL671986.1-201ENST00000422197 955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SNX31-202ENST00000428383 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NREP-208ENST00000453526 559 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PTCD2P1-201ENST00000554393 1136 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TTN-AS1-231ENST00000589434 1066 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FAM49A-202ENST00000406434 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL049636.1-201ENST00000455736 1357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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