Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLTBP09497 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLTBP09497 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLTBP09497 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLTBP09497 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLTBP09497 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLTBP09497 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLTBP09497 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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