Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GLI1P08151 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GLI1P08151 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GLI1P08151 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms