Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F6O75461 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F6O75461 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F6O75461 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F6O75461 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F6O75461 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms