Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC1O14908 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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