Protein–RNA interactions for Protein: O00488

ZNF593, Zinc finger protein 593, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF593O00488 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF593O00488 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms