Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms