Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA3Q9Y6H8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GJA3Q9Y6H8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms