Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP3Q9Y6F1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP3Q9Y6F1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP3Q9Y6F1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms