Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF18Q9Y5U5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms