Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms