Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCAF1Q9Y4C2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 335 ms