Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2L3Q9Y4A8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2L3Q9Y4A8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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