Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN4Q9Y3Q4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN4Q9Y3Q4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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