Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COQ4Q9Y3A0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms