Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A6Q9Y2P4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms