Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAN1Q9Y2M0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAN1Q9Y2M0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms