Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCE1Q9Y256 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCE1Q9Y256 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms