Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HHLA3Q9XRX5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms